More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7600 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  63.55 
 
 
444 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 
438 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  53.1 
 
 
438 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  52.36 
 
 
428 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  52.59 
 
 
428 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  52.12 
 
 
428 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  52.36 
 
 
428 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  50.59 
 
 
425 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  53.72 
 
 
428 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  52.83 
 
 
428 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  53.48 
 
 
428 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  52.2 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  52.44 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  52.2 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  52.2 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  52 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  51.98 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  51.95 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  49.1 
 
 
457 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
443 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.87 
 
 
454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  52.54 
 
 
425 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  52.46 
 
 
429 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
427 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.95 
 
 
425 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  51.6 
 
 
499 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  50.51 
 
 
461 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 
424 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  46.45 
 
 
452 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
435 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.87 
 
 
435 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  47.29 
 
 
413 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  47.29 
 
 
413 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
425 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46.34 
 
 
447 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.92 
 
 
438 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.68 
 
 
438 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.92 
 
 
438 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  45.66 
 
 
440 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  47.72 
 
 
445 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  45.8 
 
 
438 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.61 
 
 
430 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  47.76 
 
 
445 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  45.2 
 
 
438 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  47.48 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  46.65 
 
 
435 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  47.48 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
417 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  46.9 
 
 
430 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  45.35 
 
 
435 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  45.35 
 
 
435 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  47.48 
 
 
445 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  47.48 
 
 
420 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.4 
 
 
435 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  46.15 
 
 
435 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.4 
 
 
435 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  46.89 
 
 
443 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  46.89 
 
 
443 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  46.9 
 
 
435 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  46.89 
 
 
443 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  47.32 
 
 
440 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45.71 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.97 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  44.74 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  45.39 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  46.6 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  45.39 
 
 
437 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  43.99 
 
 
436 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.47 
 
 
431 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  46.12 
 
 
443 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  44.74 
 
 
431 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  45.37 
 
 
430 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.42 
 
 
436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.72 
 
 
437 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
438 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
433 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  43.88 
 
 
436 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  45.76 
 
 
441 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  45.74 
 
 
442 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.21 
 
 
439 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  41.57 
 
 
453 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.4 
 
 
436 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  44.09 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.45 
 
 
466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  42.96 
 
 
444 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  41.87 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  45.12 
 
 
437 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  40.9 
 
 
437 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>