More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0717 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  97.41 
 
 
425 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  95.06 
 
 
425 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  80 
 
 
425 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  84.54 
 
 
499 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  97.41 
 
 
425 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  86.44 
 
 
427 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  80.47 
 
 
425 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  76.94 
 
 
425 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  97.18 
 
 
425 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  57.76 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  56.07 
 
 
428 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  55.84 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  54.85 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  55.84 
 
 
428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  55.37 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  56.31 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  56.53 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  56.46 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 
438 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 
438 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 
429 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  51.62 
 
 
435 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  51.62 
 
 
452 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.02 
 
 
454 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  51.62 
 
 
425 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  52.76 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.45 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  52.2 
 
 
442 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  50.87 
 
 
413 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  50.87 
 
 
413 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  50.95 
 
 
431 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  50.37 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  50.47 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  49.52 
 
 
447 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.82 
 
 
435 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  50.13 
 
 
438 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  50.13 
 
 
438 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.52 
 
 
438 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  49.87 
 
 
438 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  50.13 
 
 
438 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.89 
 
 
430 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.04 
 
 
436 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  48.53 
 
 
435 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  48.04 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  46.6 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  48.28 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  46.6 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  48.04 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  48.04 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  47.9 
 
 
440 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  49 
 
 
417 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 
438 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  47.07 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  49.62 
 
 
438 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  48.4 
 
 
430 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  47.73 
 
 
431 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  45.65 
 
 
439 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.39 
 
 
436 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.94 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.84 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  46.84 
 
 
441 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.41 
 
 
436 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  43.13 
 
 
436 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  45.95 
 
 
447 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  46.08 
 
 
442 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  44.66 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  44.26 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.09 
 
 
452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.57 
 
 
440 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45 
 
 
443 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
452 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  43.57 
 
 
433 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.55 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.28 
 
 
437 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  45.75 
 
 
428 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  46.06 
 
 
443 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.28 
 
 
437 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  45.57 
 
 
443 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.31 
 
 
445 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.31 
 
 
445 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.31 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.31 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  44.29 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  44.28 
 
 
437 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>