More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4150 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  100 
 
 
431 aa  854    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  55.19 
 
 
427 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  57.24 
 
 
428 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  56.53 
 
 
428 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  56.53 
 
 
428 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  55.37 
 
 
428 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  56.53 
 
 
428 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  54.61 
 
 
440 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  55.58 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  54.91 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  51.66 
 
 
425 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  51.42 
 
 
425 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  48.59 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  48.59 
 
 
435 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  51.31 
 
 
425 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  49.28 
 
 
425 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  50.95 
 
 
425 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  50.59 
 
 
425 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  50.95 
 
 
425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.07 
 
 
425 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  50.95 
 
 
425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  50.95 
 
 
425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  49.63 
 
 
413 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  49.63 
 
 
413 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  50.24 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  50.98 
 
 
427 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 
425 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  48.95 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
438 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
438 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
443 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
438 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  44.74 
 
 
442 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
457 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.84 
 
 
454 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 
443 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  45.26 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.74 
 
 
435 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  44.44 
 
 
461 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  43.83 
 
 
436 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.12 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.12 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.41 
 
 
438 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  43.88 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  43.44 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  43.44 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  43.44 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  43.44 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  43.44 
 
 
430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.24 
 
 
438 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.2 
 
 
430 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.2 
 
 
430 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.03 
 
 
438 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  44.03 
 
 
417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  41.33 
 
 
435 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  41.81 
 
 
435 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  41.81 
 
 
435 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  41.79 
 
 
437 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.09 
 
 
435 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.09 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.09 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.58 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.87 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.87 
 
 
437 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  40.38 
 
 
435 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.28 
 
 
430 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  42.08 
 
 
431 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.75 
 
 
437 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  41.87 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  40.38 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.24 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.85 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  40.72 
 
 
439 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.61 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  42.09 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  40.76 
 
 
430 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  39.44 
 
 
448 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  39.4 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.38 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  41.61 
 
 
445 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  40.84 
 
 
440 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  41.87 
 
 
445 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  41.37 
 
 
445 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  41.37 
 
 
445 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.12 
 
 
436 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  38.39 
 
 
436 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  40.14 
 
 
433 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  41.63 
 
 
443 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  41.37 
 
 
445 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  41.12 
 
 
441 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  41.36 
 
 
441 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  40.33 
 
 
443 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  40.33 
 
 
443 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  41.48 
 
 
443 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  39.45 
 
 
438 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  42.22 
 
 
420 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  38.2 
 
 
466 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>