More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5468 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  100 
 
 
437 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  45.75 
 
 
453 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  46.23 
 
 
448 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  44.39 
 
 
466 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  46.17 
 
 
437 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  46.17 
 
 
437 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.76 
 
 
443 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  45 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
437 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.1 
 
 
443 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.1 
 
 
443 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.1 
 
 
443 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.1 
 
 
443 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.22 
 
 
437 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  42.82 
 
 
440 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  41.87 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  40.67 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.65 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  40.67 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  40.43 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
439 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
445 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.87 
 
 
435 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
439 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.87 
 
 
435 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.63 
 
 
435 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.04 
 
 
435 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  40.43 
 
 
438 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
445 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.04 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.09 
 
 
431 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
445 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  44.34 
 
 
439 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
445 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
445 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.81 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  41.47 
 
 
430 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.06 
 
 
420 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  40.65 
 
 
435 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
443 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  40.9 
 
 
442 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
430 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.32 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  44.29 
 
 
437 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  41.34 
 
 
440 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  43.66 
 
 
441 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.09 
 
 
430 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  43.43 
 
 
441 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  41.44 
 
 
432 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.57 
 
 
430 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 
434 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 
434 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  43.19 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  43.19 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.97 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  42.34 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  40.05 
 
 
447 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  42.96 
 
 
441 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  43.11 
 
 
440 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.81 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  41.13 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  40.14 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  41.13 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
444 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  39.81 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  42.64 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  38.73 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  38.24 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  38.05 
 
 
437 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  40 
 
 
425 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  39.28 
 
 
425 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  39.28 
 
 
425 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  39.28 
 
 
425 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  42.39 
 
 
430 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  39.76 
 
 
425 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  39.42 
 
 
439 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  38.54 
 
 
425 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  38.44 
 
 
439 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  42.24 
 
 
463 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  41.08 
 
 
441 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  38.41 
 
 
440 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  41.36 
 
 
433 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  40.23 
 
 
426 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  40.23 
 
 
426 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  40.23 
 
 
426 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  36.99 
 
 
436 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.05 
 
 
436 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  36.9 
 
 
436 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  35.54 
 
 
440 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  36.59 
 
 
425 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>