More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6393 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  84.95 
 
 
430 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  85.19 
 
 
430 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  98.16 
 
 
435 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  97.24 
 
 
435 aa  831    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  86.3 
 
 
417 aa  718    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  97 
 
 
435 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  85.19 
 
 
430 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  97.93 
 
 
435 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  85.65 
 
 
430 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  84.95 
 
 
430 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.19 
 
 
430 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  93.79 
 
 
435 aa  802    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  82.9 
 
 
430 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  84.95 
 
 
430 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  97.93 
 
 
435 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  82.74 
 
 
440 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  84.95 
 
 
430 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 
443 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  52.86 
 
 
447 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 
443 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.05 
 
 
437 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.03 
 
 
435 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.95 
 
 
461 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  52.04 
 
 
438 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  52.04 
 
 
438 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  52.01 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  51.54 
 
 
439 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  52.21 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  50 
 
 
436 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  49.13 
 
 
436 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  50.25 
 
 
436 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  50.96 
 
 
438 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  50.24 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  48.76 
 
 
436 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  50.62 
 
 
431 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  50.36 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  51.72 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 
438 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  53.04 
 
 
433 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 
438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  47.86 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  46.93 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  49.49 
 
 
499 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  48.28 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.4 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  48.28 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  48.28 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  46.56 
 
 
425 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 
425 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  48.76 
 
 
427 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.76 
 
 
454 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.69 
 
 
436 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  47.51 
 
 
425 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 
457 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.67 
 
 
438 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
427 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  48.21 
 
 
425 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  47.26 
 
 
428 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.65 
 
 
442 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.3 
 
 
428 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.06 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  46.06 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 
433 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.59 
 
 
440 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.88 
 
 
443 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  43.52 
 
 
431 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.77 
 
 
443 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.77 
 
 
443 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.77 
 
 
443 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.24 
 
 
440 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  47.83 
 
 
441 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.1 
 
 
443 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  46.3 
 
 
428 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.87 
 
 
443 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.06 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.43 
 
 
445 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  46.54 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
445 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  46.78 
 
 
428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.33 
 
 
453 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.06 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.06 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.85 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  40.65 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.96 
 
 
437 aa  336  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  42.95 
 
 
466 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.94 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.94 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
437 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.94 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  45.19 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.28 
 
 
420 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  43.96 
 
 
432 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.72 
 
 
434 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
434 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  46.15 
 
 
438 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
428 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
434 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.36 
 
 
452 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>