More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2186 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  100 
 
 		 440 aa  876    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  100 
 
 		 440 aa  876    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  92.5 
 
 		 440 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  65.3 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  50.34 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.85 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  52.44 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  49.01 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.29 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  44.81 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  45.97 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.26 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  44.66 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.18 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  44.66 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  44.66 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.42 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.42 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.66 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.65 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.66 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  44.5 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  45.74 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.66 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  43.69 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  43.84 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.97 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  44.44 
 
 		 441 aa  315  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  43.48 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.61 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  42.24 
 
 		 444 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 457 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  42.62 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.38 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  39.76 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  39.28 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  39.28 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  40.46 
 
 		 437 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  39.22 
 
 		 413 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  39.22 
 
 		 413 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  40.1 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  39.53 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  41.31 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  40.4 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>