More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6616 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
452 aa  900    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  95.8 
 
 
452 aa  865    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  66.12 
 
 
449 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
443 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  44.09 
 
 
461 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.45 
 
 
435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  41.81 
 
 
425 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  42.04 
 
 
425 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  41.89 
 
 
438 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  41.89 
 
 
438 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  41.89 
 
 
438 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  42.62 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  41.69 
 
 
425 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  40.52 
 
 
447 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  41.33 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  41.33 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.64 
 
 
430 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  41.33 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 
457 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
430 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
427 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.75 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  41.61 
 
 
440 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.47 
 
 
435 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  43.34 
 
 
436 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  40.91 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  41.71 
 
 
438 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  41.18 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
425 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.12 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.12 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.12 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  40.82 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  40.77 
 
 
438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  41.61 
 
 
430 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  41.61 
 
 
430 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
417 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  41.26 
 
 
439 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  40.58 
 
 
435 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.81 
 
 
454 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  39.28 
 
 
440 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.07 
 
 
436 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.78 
 
 
439 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.29 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  42.82 
 
 
428 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  41.14 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  40.91 
 
 
428 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.13 
 
 
431 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.05 
 
 
436 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  41.04 
 
 
425 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  40.99 
 
 
427 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.19 
 
 
436 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  41.14 
 
 
428 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.14 
 
 
430 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  41.18 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  39.71 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
429 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.9 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  41.18 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  38.46 
 
 
437 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  38.93 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  40.68 
 
 
428 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 
444 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  38.34 
 
 
440 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  38.85 
 
 
433 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  40.36 
 
 
441 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  38.44 
 
 
442 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
437 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  38.92 
 
 
437 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 
424 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
425 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  38.24 
 
 
437 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  37.41 
 
 
438 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  39.28 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  37.82 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  37.41 
 
 
438 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
439 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  37.82 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  38.67 
 
 
437 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  39.76 
 
 
445 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  38.01 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  37.3 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  35.83 
 
 
443 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  35.07 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  40 
 
 
445 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  38.95 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
439 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  38.57 
 
 
445 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  35.21 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  37.41 
 
 
448 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  38.69 
 
 
445 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  38.57 
 
 
445 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  38.57 
 
 
445 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>