More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2288 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2288  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
429 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0638565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  51.92 
 
 
434 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  46.23 
 
 
433 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  46.04 
 
 
433 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  45.97 
 
 
431 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  45.52 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  44.85 
 
 
535 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  46.72 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 
434 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 
434 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.62 
 
 
440 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.09 
 
 
443 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.53 
 
 
435 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.35 
 
 
443 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  43.44 
 
 
430 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.44 
 
 
437 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  42.58 
 
 
434 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.35 
 
 
443 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.35 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.84 
 
 
443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  43.35 
 
 
440 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.47 
 
 
430 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.15 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.15 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.86 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  41.61 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  47.23 
 
 
463 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.94 
 
 
435 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.94 
 
 
435 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.94 
 
 
435 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
433 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  41.61 
 
 
435 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
439 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  41.61 
 
 
435 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  42.07 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
439 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
440 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  42.93 
 
 
437 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
417 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.17 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.71 
 
 
430 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.31 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  39.58 
 
 
448 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  41.49 
 
 
447 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 
443 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
420 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
445 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
445 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
438 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
445 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.14 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
438 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  38.84 
 
 
453 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  43.78 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  43.78 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  43.78 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  40.87 
 
 
439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  40.43 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  40.43 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  41.95 
 
 
425 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.07 
 
 
437 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  40 
 
 
438 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  39.07 
 
 
438 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  41.39 
 
 
441 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  38.84 
 
 
438 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  39.9 
 
 
442 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  41.2 
 
 
461 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  41.73 
 
 
438 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  40.91 
 
 
441 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  40.91 
 
 
441 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  42.76 
 
 
428 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  40.4 
 
 
438 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  38.32 
 
 
466 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  39.06 
 
 
432 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.58 
 
 
425 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  40.91 
 
 
441 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  42.24 
 
 
428 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.02 
 
 
436 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  42.52 
 
 
428 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  42.52 
 
 
428 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  40.67 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
425 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  39.66 
 
 
438 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  43.52 
 
 
428 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 
427 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  43.52 
 
 
428 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  40.83 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  42.41 
 
 
428 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.61 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.61 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.61 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>