More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4266 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  100 
 
 		 435 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  80.88 
 
 		 436 aa  673    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  81.11 
 
 		 436 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  87.19 
 
 		 439 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  81.11 
 
 		 436 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  70.49 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  70.49 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  70.85 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  67.78 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  68.02 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  50.83 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  46.03 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  50 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  46.96 
 
 		 531 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  45.75 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  45.37 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  45.28 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  45.73 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  45.75 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  45.26 
 
 		 493 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  45.5 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  49.63 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  45.52 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  44.18 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  46.24 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  43.94 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  44.79 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  45.65 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  46.82 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  46.82 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  46.46 
 
 		 628 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  45.99 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  43.98 
 
 		 458 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  43.18 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  43.18 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  43.18 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  44.34 
 
 		 493 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  44.52 
 
 		 495 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  43.35 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  41.32 
 
 		 500 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  40.41 
 
 		 500 aa  343  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  40.41 
 
 		 500 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  40.63 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  44.37 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  39.77 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  41.1 
 
 		 500 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  41.1 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  40.23 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  41.1 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  40.41 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  49.19 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  40.74 
 
 		 500 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  40.74 
 
 		 500 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  40.74 
 
 		 500 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  40.74 
 
 		 500 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  45.41 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  44.01 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.16 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  42.12 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  44.21 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  44.93 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  42.14 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  46.57 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  40.52 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  44.68 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.84 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  40.56 
 
 		 530 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 448 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  41.08 
 
 		 465 aa  312  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 445 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.28 
 
 		 445 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  41.44 
 
 		 495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.734209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>