More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1103 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  70.07 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  69.86 
 
 		 445 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  69.53 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  69.79 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  66.9 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  67.36 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  65.08 
 
 		 434 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  42.34 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  42.52 
 
 		 531 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  42.59 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  41.09 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  43.41 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  40.83 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  42.32 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  40.86 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  40.52 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  40.18 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  41.16 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  43.57 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  41.81 
 
 		 527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  43.06 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  41.81 
 
 		 488 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  41.81 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  43.65 
 
 		 444 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  40.86 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  41.53 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  41.53 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  41.53 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  42.13 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  40.28 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  45.08 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  45.08 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  41.57 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  39.86 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  45.08 
 
 		 436 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  46.56 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  46.4 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  40.18 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  42.28 
 
 		 628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  40.43 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  41.33 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  42.24 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  46.17 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  43.7 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.12 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  39.66 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 626 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  40.46 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  41.32 
 
 		 461 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  38.62 
 
 		 500 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  45.32 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  40.32 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  38.73 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  40.47 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  40.87 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  40.87 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  38.05 
 
 		 530 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  40.05 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  41.63 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  40.41 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  38.73 
 
 		 485 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  38.67 
 
 		 500 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  38.73 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  38.73 
 
 		 485 aa  292  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  292  9e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  37.35 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  37.35 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  37.35 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  44.36 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  38.73 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  40.1 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  37.35 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  38.53 
 
 		 500 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  37.12 
 
 		 500 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  38.48 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  39.58 
 
 		 493 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>