More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1253 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  94.13 
 
 		 491 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 495 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 495 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  100 
 
 		 496 aa  986    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 628 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  81.02 
 
 		 489 aa  742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  95.16 
 
 		 495 aa  889    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  78.75 
 
 		 489 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  78.96 
 
 		 489 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 534 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  78.71 
 
 		 489 aa  750    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 534 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  82.59 
 
 		 626 aa  762    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  79.1 
 
 		 503 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  79.52 
 
 		 489 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  99.34 
 
 		 452 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  78.74 
 
 		 552 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 495 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  78.96 
 
 		 489 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  85.11 
 
 		 495 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  78.46 
 
 		 488 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  94.35 
 
 		 493 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  93.37 
 
 		 527 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  80.75 
 
 		 503 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  76.95 
 
 		 531 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  99.19 
 
 		 496 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  62.2 
 
 		 495 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  52.35 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  52.35 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  52.78 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  53.52 
 
 		 500 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  51.92 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  51.92 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  51.71 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  50.63 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.63 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  50.21 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  50.21 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  50.21 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  50.63 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  50.74 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  50.42 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  50.84 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  50.63 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  50.74 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  50.63 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  51.5 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  56.46 
 
 		 493 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  54.47 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  48.62 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  48.41 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  48.41 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  48.41 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  49.35 
 
 		 482 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  48.41 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  48.41 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  48.41 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  49.04 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  48.2 
 
 		 485 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  47.98 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  55 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  54.73 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  44.69 
 
 		 530 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  53.76 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.734209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  44.97 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  49.1 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  47.42 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  47.02 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  45.21 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  45.21 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  45.21 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  48.01 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  47.09 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.71 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  42.95 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  44.69 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  45.58 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0610  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0596  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  46.39 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  46.17 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  46.17 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  41.59 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  46.09 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  45.87 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1065  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0223  major facilitator family transporter  44.35 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  44.7 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  44.7 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  44.7 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  46.35 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  42.37 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  46.24 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  43.43 
 
 		 446 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  41.68 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  42.36 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  39.6 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  42.65 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>