More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4433 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  100 
 
 		 450 aa  889    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  62.75 
 
 		 445 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  65.28 
 
 		 461 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  65.05 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  65.05 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  62.22 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  62.22 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  58.69 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  58.69 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  58.69 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  58.92 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  59.39 
 
 		 453 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  59.29 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  56.57 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  54.85 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  50.11 
 
 		 472 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  44.97 
 
 		 489 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  44.75 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  44.52 
 
 		 531 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  44.98 
 
 		 496 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  45.16 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  44.8 
 
 		 467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  44.52 
 
 		 503 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  44.2 
 
 		 496 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  46.99 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  44.47 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  44.47 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  44.95 
 
 		 527 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 489 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  44.25 
 
 		 489 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  43.62 
 
 		 552 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  44.47 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  43.65 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  43.27 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  41.5 
 
 		 493 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  42.25 
 
 		 500 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 534 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  44.5 
 
 		 534 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  45.67 
 
 		 452 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 485 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  40.55 
 
 		 485 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  44.6 
 
 		 628 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 485 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 485 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  42.99 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  40.32 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  40.55 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  40.55 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  43.12 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  40.32 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  40.09 
 
 		 485 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  42.02 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.02 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  42.02 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  42.02 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  42.02 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  41.78 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  41.78 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  41.78 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  42.42 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  45.03 
 
 		 626 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  41.31 
 
 		 500 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  42.42 
 
 		 500 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  42.49 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  42.49 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  42.49 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  42.19 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  42.25 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  39.56 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  41.76 
 
 		 480 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  40.22 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  45.73 
 
 		 481 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  40.5 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  40.04 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  39.47 
 
 		 495 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.734209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  39.19 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  38.72 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  38.79 
 
 		 526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  39.18 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 452 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1065  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 445 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  37.06 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  38.26 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  37.38 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0610  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0596  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>