More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0334 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
426 aa  828    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.71 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  45.52 
 
 
438 aa  289  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  38.28 
 
 
434 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  39.53 
 
 
427 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  39.11 
 
 
439 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  37.87 
 
 
436 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  37.87 
 
 
436 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  37.87 
 
 
436 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  37.1 
 
 
438 aa  255  9e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  35.97 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.85 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.57 
 
 
437 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  36.74 
 
 
441 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  36.1 
 
 
454 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  36.62 
 
 
433 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  36.98 
 
 
441 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  36.98 
 
 
445 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  36.88 
 
 
435 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  35.98 
 
 
481 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  34.52 
 
 
493 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  34.52 
 
 
491 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  36.56 
 
 
422 aa  248  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.1 
 
 
439 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  34.28 
 
 
495 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  34.45 
 
 
433 aa  245  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  33.81 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  34.28 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  34.28 
 
 
457 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  37.37 
 
 
439 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  32.7 
 
 
493 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  34.73 
 
 
446 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.28 
 
 
457 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  33.81 
 
 
496 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  33.81 
 
 
496 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 
454 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  36.1 
 
 
441 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  38.1 
 
 
432 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
443 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.65 
 
 
444 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  34.86 
 
 
430 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  35.55 
 
 
489 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  36.87 
 
 
422 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  33.73 
 
 
452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  34.38 
 
 
441 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.76 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  33.9 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  36.29 
 
 
433 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.64 
 
 
447 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  32.85 
 
 
431 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  36.88 
 
 
441 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  36.56 
 
 
445 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  34.46 
 
 
552 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  35.07 
 
 
531 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  37 
 
 
467 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  35.46 
 
 
495 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  35.46 
 
 
495 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  35.46 
 
 
495 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  35.46 
 
 
534 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  36.74 
 
 
461 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  35.46 
 
 
534 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  35.46 
 
 
495 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
446 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  34.28 
 
 
489 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  33.01 
 
 
439 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  35.55 
 
 
628 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  34.94 
 
 
489 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  34.94 
 
 
489 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  33.01 
 
 
439 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  34.94 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  33.41 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.84 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  33.09 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  34.7 
 
 
489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  32.93 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  34.67 
 
 
460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  33.89 
 
 
503 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.65 
 
 
444 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.84 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  37.53 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  35.46 
 
 
626 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.25 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  37.05 
 
 
445 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  35.99 
 
 
438 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  36.23 
 
 
449 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.46 
 
 
430 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  32.24 
 
 
455 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.3 
 
 
435 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.3 
 
 
435 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.41 
 
 
495 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.3 
 
 
435 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.59 
 
 
444 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  37.05 
 
 
445 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  31.37 
 
 
446 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  37.56 
 
 
448 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  36.8 
 
 
445 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>