More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1395 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  841    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  53.65 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.63 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  34.67 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  34.32 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.42 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.26 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.74 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  36.11 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  34.25 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  34.25 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  34.25 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.44 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  34.53 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  32.07 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  32.48 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  33.1 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  30.97 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  33.08 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  32.71 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.97 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.18 
 
 		 459 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  35.49 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0426  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  33.8 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  35.06 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.65 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 481 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.34 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  30.34 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  33.56 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  32.82 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  34.88 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  30.34 
 
 		 500 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  28.14 
 
 		 493 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 461 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  34.38 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  32.64 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  32.27 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  30.11 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  30.11 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  32.49 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>