More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0351 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  39.51 
 
 
444 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  39.01 
 
 
444 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  38.77 
 
 
444 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
425 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  38.35 
 
 
461 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  38.4 
 
 
444 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  40.69 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
443 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  39 
 
 
440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
424 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.85 
 
 
438 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.29 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.85 
 
 
438 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  38.21 
 
 
431 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  39.14 
 
 
425 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  39.14 
 
 
425 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  36.43 
 
 
431 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  37.16 
 
 
444 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  37.09 
 
 
438 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.62 
 
 
438 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  35.85 
 
 
449 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  37.41 
 
 
420 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  35.86 
 
 
447 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  39.45 
 
 
425 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  38.97 
 
 
425 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  38.97 
 
 
425 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  38.97 
 
 
425 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  38.31 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  36.34 
 
 
452 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.78 
 
 
433 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
443 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  38.59 
 
 
428 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6405  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  37.38 
 
 
427 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
438 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  36.1 
 
 
425 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  37.12 
 
 
438 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  36.6 
 
 
441 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  36.1 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.91 
 
 
425 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  34.92 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  34.68 
 
 
439 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  38.65 
 
 
428 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
435 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
438 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  37.71 
 
 
435 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
425 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  37.86 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  35.93 
 
 
456 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  37.86 
 
 
428 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  37.62 
 
 
428 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  33.82 
 
 
432 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  35.92 
 
 
440 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  36.43 
 
 
440 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  34.12 
 
 
438 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  36.43 
 
 
440 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  36.43 
 
 
441 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  38.21 
 
 
499 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  36.43 
 
 
441 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  34.47 
 
 
445 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  38.26 
 
 
428 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.71 
 
 
452 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  36.43 
 
 
440 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.89 
 
 
495 aa  262  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
457 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 
433 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  35.92 
 
 
440 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  35.92 
 
 
440 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  36.41 
 
 
440 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
452 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  35.81 
 
 
446 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  35.86 
 
 
413 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  35.86 
 
 
413 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  38.01 
 
 
428 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  37.25 
 
 
454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  34.98 
 
 
448 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  35.63 
 
 
438 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  32.29 
 
 
500 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.86 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
439 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  34.46 
 
 
445 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  32.56 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  34.45 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  32.68 
 
 
500 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  33.87 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  32.79 
 
 
440 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.3 
 
 
500 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
445 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
439 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
445 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
445 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.67 
 
 
435 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.68 
 
 
500 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
445 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  31.41 
 
 
500 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.41 
 
 
500 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  31.41 
 
 
500 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  31.41 
 
 
500 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  31.41 
 
 
500 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>