More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10171 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  100 
 
 		 420 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  59.95 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5864  general substrate transporter  40.05 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256271  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  36.8 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  37.41 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  37.95 
 
 		 436 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  37.95 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  37.95 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  34.81 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  36.63 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  36.71 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  36.71 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  36.54 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  36.14 
 
 		 489 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  37.11 
 
 		 489 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  37.11 
 
 		 489 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  35.02 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  37.44 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  36.87 
 
 		 489 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  36.87 
 
 		 503 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  35.38 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.98 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 489 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  35.82 
 
 		 496 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  35.34 
 
 		 493 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  35.66 
 
 		 552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  34.48 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  34.37 
 
 		 500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  35.34 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  35.58 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  35.34 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  34.13 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  34.13 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  34.13 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  36.6 
 
 		 440 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  34.61 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  36.6 
 
 		 440 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  36.39 
 
 		 503 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  35.34 
 
 		 491 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.41 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  35.1 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  36.21 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  33.41 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  34.05 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  35.7 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.32 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  36.06 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  36.21 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  35.96 
 
 		 485 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  36.21 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.26 
 
 		 439 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  35.96 
 
 		 485 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  34.62 
 
 		 495 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.26 
 
 		 471 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.26 
 
 		 439 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  34.73 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 440 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.65 
 
 		 439 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 485 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  35.71 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  35.89 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.14 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>