More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5864 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5864  general substrate transporter  100 
 
 		 448 aa  884    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256271  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  40.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  42.99 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  41.3 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  40.15 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  40.31 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 436 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  37 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  36.68 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.14 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  38.22 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  39.04 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.14 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 445 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  35.96 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  36.96 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  37.11 
 
 		 531 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  37.05 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  37.38 
 
 		 496 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.51 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  37.05 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  35.9 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  39.39 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  41.16 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  41.16 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  36.82 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  41.16 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  38.81 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  37.38 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  39.39 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.49 
 
 		 495 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 489 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  37.38 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 461 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 495 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  37.38 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  34.86 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  35.53 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  36.47 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  34.39 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  37.41 
 
 		 439 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  37.82 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  36.04 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.68 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  37.04 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2314  hypothetical protein  34.55 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  36.65 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.22 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.22 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.58 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  34.22 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  32.81 
 
 		 500 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  38.37 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  38.82 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33590  predicted protein  35.82 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.87 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  38.37 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  38.37 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>