More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2177 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  867    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 422 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 435 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  37.12 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  37.21 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  36.9 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.28 
 
 		 491 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  34.19 
 
 		 552 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  36.04 
 
 		 527 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.9 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  34.3 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33.04 
 
 		 531 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  36.87 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  32.97 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  38.42 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0329  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.93 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000181979  normal  0.0690464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.42 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  36.26 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  36.3 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  33.18 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  35.32 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  32.61 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  36.34 
 
 		 434 aa  242  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  33.26 
 
 		 489 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.05 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  33.26 
 
 		 489 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  33.81 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  32.73 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  33.81 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  34.77 
 
 		 493 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 628 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  36.45 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  34.92 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  33.04 
 
 		 489 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.18 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  34.78 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  33.26 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.87 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  37.19 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  35.99 
 
 		 626 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 425 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  36.47 
 
 		 461 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  36.88 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  36.47 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  36.47 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  36.63 
 
 		 461 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6405  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  32.39 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  35.6 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  35.6 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  35.6 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  32.55 
 
 		 500 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  32.88 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.55 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  30.44 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  35.6 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.96 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  36.14 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  33.65 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.08 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  35.37 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  34.81 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>