More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0730 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  100 
 
 		 438 aa  847    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 438 aa  455  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.81 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  36.16 
 
 		 468 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 481 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  38.9 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  35.28 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  37.24 
 
 		 439 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  35.51 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.46 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.28 
 
 		 484 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  35.04 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.56 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  32.33 
 
 		 489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  34.28 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.28 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  34.28 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  34.28 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  33.79 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  34.28 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  34.28 
 
 		 500 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  34.06 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  33.84 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  34.06 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  33.84 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  34.06 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  34.69 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  33.84 
 
 		 500 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.86 
 
 		 531 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.63 
 
 		 496 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  33.64 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.83 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  32.41 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  31.86 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  31.86 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  32.97 
 
 		 500 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  34.81 
 
 		 442 aa  226  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  30.93 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  31.63 
 
 		 489 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  32.4 
 
 		 500 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  31.76 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.4 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1251  general substrate transporter  37.13 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  34.74 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  35.09 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  31.63 
 
 		 527 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.79 
 
 		 437 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  35.32 
 
 		 432 aa  223  8e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 495 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 487 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  31.86 
 
 		 496 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  31.86 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  31.78 
 
 		 459 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  31.35 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  36.64 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  31.4 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.72 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  32.03 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>