More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4107 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  70.95 
 
 		 454 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  39.2 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.86 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  38.94 
 
 		 444 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  36.67 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 435 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 435 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 435 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  38.3 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.04 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 446 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  35.6 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 628 aa  266  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.05 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.08 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 442 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  34.73 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.68 
 
 		 437 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  38.34 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.71 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  37.95 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.24 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.24 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.24 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 454 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 445 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.62 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 461 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  36.03 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  36.93 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.26 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 461 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.4 
 
 		 459 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  35.32 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  36.51 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.36 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  37.38 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35.52 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.45 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.22 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  38.66 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.39 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.52 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  36.17 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  36.17 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  37.67 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  37.28 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.1 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.17 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.47 
 
 		 447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.14 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  36.34 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.14 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.14 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.41 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  38.12 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.51 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  36.63 
 
 		 435 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  36.63 
 
 		 435 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>