More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2153 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  99.09 
 
 		 438 aa  847    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  100 
 
 		 443 aa  865    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  40.44 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  40 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  39.7 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  40 
 
 		 435 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 429 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  39.9 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  38.12 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  38.77 
 
 		 476 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  38.77 
 
 		 476 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  39.71 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 435 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.79 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  35.2 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.15 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  35.07 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  37.02 
 
 		 431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  40 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  40 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  40 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  40 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  40 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  40 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  34.6 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.52 
 
 		 456 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 458 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 458 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  36.87 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  34.36 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  33.33 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.55 
 
 		 443 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  32.29 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  32.51 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  38.24 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.29 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.04 
 
 		 482 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33.56 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  33.03 
 
 		 527 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  33.33 
 
 		 489 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  33.18 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  32.33 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  32.19 
 
 		 500 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  32.19 
 
 		 500 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  32.1 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.34 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.83 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.31 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  34.83 
 
 		 431 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  32.33 
 
 		 491 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>