More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4657 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  875    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  42.89 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  43.77 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 467 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  40.45 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  38.89 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  40.52 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  42.68 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  42.68 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  42.68 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  41.63 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  41.57 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  39.71 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.43 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  40.32 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  40.32 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  38.2 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  38.2 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  38.2 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  39.86 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  40.58 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  35.97 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.19 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  36.51 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  39.95 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  37.97 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  38.16 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  39.26 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  38.11 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  35.93 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  35.22 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  37.56 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  38.04 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  36.93 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  35.8 
 
 		 496 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.28 
 
 		 493 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  36.58 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  36.15 
 
 		 503 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  36.58 
 
 		 485 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 485 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1369  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  39.69 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  35.45 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  33.81 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  36.34 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  33.81 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  34.04 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  33.57 
 
 		 500 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  34.99 
 
 		 500 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 500 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 500 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 500 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  34.04 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.04 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  34.04 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  34.04 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  34.04 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  35.55 
 
 		 496 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  36.21 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  35.99 
 
 		 491 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.38 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 495 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  37.07 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  36.84 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  35.39 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  36.02 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  35.87 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  36.02 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  35.32 
 
 		 527 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  34.28 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  35.02 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  35.78 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  33.57 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 463 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.46 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>