More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1369 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1369  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  893    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  79.29 
 
 		 449 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3550  major facilitator transporter  63.75 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0636824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  37.86 
 
 		 531 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  37.14 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  36.66 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  36.47 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  42.4 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  35.21 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 489 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  37.11 
 
 		 493 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  35.49 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  35.97 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  35.97 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  39.09 
 
 		 444 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  36.98 
 
 		 431 aa  272  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  35.75 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  39.95 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  38.86 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  37.85 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  37.67 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  37.67 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.88 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  38.86 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  36.92 
 
 		 456 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  38.22 
 
 		 483 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 485 aa  269  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 485 aa  269  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  39.47 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  39.86 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  38.52 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  36.92 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  36.88 
 
 		 526 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  34.09 
 
 		 503 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.43 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  35.08 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  35.83 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  35.83 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  35.83 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  32.88 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.27 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  32.88 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  35.78 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  37.08 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  36.03 
 
 		 527 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  36.82 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.03 
 
 		 491 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.66 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  36.57 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  35.82 
 
 		 488 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  39.23 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  39.23 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  38.62 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  39.23 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  34.16 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.71 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  34.59 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  36.95 
 
 		 449 aa  252  7e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  33.26 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.26 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  33.26 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  33.26 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  33.26 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  36.34 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  36.47 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  33.03 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  34.68 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  33.33 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  36.24 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 534 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  35.71 
 
 		 534 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  36.25 
 
 		 628 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.29 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  38.21 
 
 		 481 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>