More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1037 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 445 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  42.65 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  42.65 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  42.65 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  38.8 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  34.5 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  36.94 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  40.28 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  35.16 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  36.92 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  37.65 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  34.96 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  36.77 
 
 		 489 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  34.03 
 
 		 500 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  36.21 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  41.45 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  33.8 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  33.8 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  33.8 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  34.73 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  38.08 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  35.88 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  36.53 
 
 		 531 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.28 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 445 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  34.83 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.3 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  33.1 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  34.11 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 500 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  36.21 
 
 		 489 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  36.21 
 
 		 489 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  34.27 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  37.05 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.6 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  35.88 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  39.31 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  35.36 
 
 		 527 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  39.26 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  39.26 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  35.98 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  33.57 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  33.72 
 
 		 500 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  39.76 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 534 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 534 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.8 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  36.88 
 
 		 628 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.71 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  37.32 
 
 		 434 aa  252  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  36.88 
 
 		 626 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  36.24 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  36.24 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  32.4 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  35.8 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  35.98 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  32.4 
 
 		 500 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  35.68 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  35.43 
 
 		 493 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  38.57 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  36.04 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  36.04 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  36.04 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  34.42 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  32 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  34.1 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>