More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0292 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  847    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  37.67 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  36.36 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  38.3 
 
 		 500 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  36.36 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  37.13 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  37.13 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  37.13 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  36.9 
 
 		 500 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  36.14 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.14 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  36.14 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  36.14 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  36.14 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  36.22 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  36.22 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  35.99 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  35.99 
 
 		 500 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  35.99 
 
 		 500 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  37 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  38.52 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  36.67 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  36.67 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  36.67 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.77 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  35.93 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.77 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  36.04 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  34.47 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  35.5 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  36.71 
 
 		 495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 467 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  35.04 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 422 aa  243  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.84 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 454 aa  240  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  34.12 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  34.59 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  34.59 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  34.59 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  34.59 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  36.2 
 
 		 441 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  32.52 
 
 		 530 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  35.37 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  36.75 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  36.52 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  33.26 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  36.75 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  36.2 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  34.96 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  34.52 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.49 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  34.83 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  34.99 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33.02 
 
 		 531 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  34.58 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  31.9 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  31.47 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  32.33 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  31.38 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  32.23 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  31.86 
 
 		 493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 438 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  34.06 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  31.15 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  31.62 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  34.34 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  34.79 
 
 		 420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  31.28 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 452 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  32.01 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 461 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  32.01 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  32.85 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  32.06 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  32.79 
 
 		 628 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 445 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.42 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  31.78 
 
 		 489 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  33.26 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  30.07 
 
 		 552 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>