More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0849 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  100 
 
 
464 aa  892    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 
447 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  35.6 
 
 
452 aa  204  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  32.39 
 
 
478 aa  200  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  35.03 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
449 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  30.69 
 
 
446 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  31.85 
 
 
463 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  31.85 
 
 
463 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  31.85 
 
 
463 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  35.05 
 
 
449 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  31.93 
 
 
429 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  31.19 
 
 
527 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  31.78 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
405 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.31 
 
 
445 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  30.79 
 
 
450 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  29.76 
 
 
444 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.79 
 
 
496 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
454 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  33.7 
 
 
462 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  31.96 
 
 
489 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  30.91 
 
 
491 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  31.73 
 
 
426 aa  160  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  30.17 
 
 
422 aa  160  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  32.71 
 
 
439 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.54 
 
 
461 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  30.65 
 
 
495 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  31.19 
 
 
496 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  31.4 
 
 
432 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  30.08 
 
 
433 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  30.45 
 
 
489 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  29.55 
 
 
439 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  29.29 
 
 
439 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  30.45 
 
 
489 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  32.34 
 
 
461 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  32.34 
 
 
461 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  32.34 
 
 
461 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
431 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  29.38 
 
 
493 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  31.23 
 
 
452 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  32.17 
 
 
439 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  34.85 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  30.2 
 
 
489 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  29.02 
 
 
439 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  31 
 
 
454 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.33 
 
 
444 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  32.47 
 
 
438 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
430 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  31 
 
 
430 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  28.4 
 
 
432 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.65 
 
 
440 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  33.42 
 
 
433 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  30.62 
 
 
552 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  31.2 
 
 
452 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  27.68 
 
 
436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  34.22 
 
 
394 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  30.02 
 
 
444 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.03 
 
 
503 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  28.53 
 
 
447 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  30.07 
 
 
440 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  30.05 
 
 
503 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  30.07 
 
 
440 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  30.07 
 
 
440 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  29.53 
 
 
489 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  29.07 
 
 
440 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  30.07 
 
 
440 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
454 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  31.15 
 
 
444 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  30.64 
 
 
495 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  29.33 
 
 
444 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  30.64 
 
 
495 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  30.64 
 
 
495 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
439 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  31.15 
 
 
444 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  30.07 
 
 
440 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  31.17 
 
 
427 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
438 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
466 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  30.64 
 
 
495 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
452 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
446 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  28.76 
 
 
435 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  28.76 
 
 
435 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  30.47 
 
 
422 aa  151  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  29.35 
 
 
530 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  29.86 
 
 
467 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  29.02 
 
 
456 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  28.76 
 
 
435 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  28.23 
 
 
436 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  30.64 
 
 
534 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.65 
 
 
437 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  30.64 
 
 
534 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  29.53 
 
 
531 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  28.23 
 
 
436 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 
440 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
458 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  31.43 
 
 
441 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>