More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0369 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  786    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  56.57 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 478 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  29.07 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  31.09 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1055  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.367509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.12 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.64 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 477 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  27.41 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  27.95 
 
 		 443 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  25.42 
 
 		 468 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  29.05 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 461 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  28.8 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  27.71 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.52 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  28.8 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  28.95 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  28.27 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  28.81 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  28.35 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  30.11 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  28.34 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  26.33 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  26.15 
 
 		 482 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  26.6 
 
 		 485 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  26.6 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 454 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 454 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  28.5 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  26.67 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.67 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  26.43 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  26.42 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  27.75 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  26.91 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  26.67 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  26.67 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  26.91 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  26.67 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  26.35 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  27.94 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>