More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3406 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  75.23 
 
 		 449 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  871    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  74.07 
 
 		 449 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  67.79 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  67.79 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  67.34 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  69.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  32.1 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  27.8 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  29.62 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  26.85 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  28.63 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  27.39 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  27.96 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  30 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  26.85 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  31.52 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  26.64 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  26.64 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  26.64 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  28.64 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  29.14 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  28.75 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  29.14 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  29.38 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  29.88 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.07 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  28.42 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.54 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  29.72 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  29.82 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  25.34 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  27.75 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  27.63 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.1 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  25.38 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  27.5 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  25.9 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  28.18 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  27.25 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  27.95 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  26.78 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  28.18 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  28.17 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.25 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  27.89 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  29.15 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  27.67 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  25.86 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  27.21 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  29.52 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  25.86 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  28.26 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  26.75 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  26.15 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 444 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.25 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  29.63 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.25 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  25.92 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  25.92 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  28.67 
 
 		 489 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 436 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  25.92 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.84 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  28.67 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  29.63 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  28.67 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  28.82 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  27.67 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  27.67 
 
 		 436 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  29.15 
 
 		 574 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>