More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0449 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  71.56 
 
 		 449 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  99.56 
 
 		 454 aa  892    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  71.78 
 
 		 449 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  67.79 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  68.21 
 
 		 458 aa  591  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.93 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  31.07 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  30.9 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  28.17 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  28.71 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  26 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.61 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  28.57 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  27.96 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.19 
 
 		 500 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  26.39 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 628 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  32.2 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.99 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  29.77 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  26.99 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  26.99 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  28.15 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  29.57 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  27.99 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  28.15 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  27.91 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  27.16 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  27.72 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  27.64 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 628 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 534 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 534 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  28.72 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  27.16 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  29.86 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 495 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.04 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  25.79 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  26.22 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  26.57 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  27.52 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  28.47 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  28.29 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  26.57 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  26.57 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  27.09 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  28.82 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6814  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  29.1 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  30.26 
 
 		 626 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  31.65 
 
 		 563 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  28.29 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  25.97 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  29.56 
 
 		 435 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  29.81 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  29.28 
 
 		 452 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  29.56 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  26.48 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  29.23 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>