More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6814 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6814  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 445 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 445 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  37.26 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 434 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  35.28 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.47 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 448 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  35.01 
 
 		 530 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  38.73 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  38.73 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  38.73 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  37.9 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  35.25 
 
 		 483 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  35.77 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  39.08 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  35.52 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  35.5 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  35.52 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  35.52 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  35.58 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  37.53 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  36.06 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  35.58 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  36.99 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  36.53 
 
 		 430 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  32.8 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  38.11 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  32.8 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  35.89 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  34.99 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  35.22 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  32.35 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  32.21 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  32.35 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.35 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  37.96 
 
 		 436 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  32.35 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  31.98 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  35.2 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  35.08 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  34.39 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  38.54 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0329  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.79 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000181979  normal  0.0690464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.17 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.41 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  31.83 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  35.38 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  36.88 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  35.9 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.94 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  36.26 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  34.39 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 495 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  36.47 
 
 		 430 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.17 
 
 		 430 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  36.82 
 
 		 440 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 427 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  35.61 
 
 		 527 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  31.6 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.87 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  31.6 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.5 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  37.35 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  32.06 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>