More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3251 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  72.87 
 
 		 449 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  73.79 
 
 		 449 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  897    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  68.53 
 
 		 445 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  66.52 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  66.52 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  66.3 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.34 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  32.3 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  29.77 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  28.45 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  29.11 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  28.09 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  28.09 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  30.11 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  27.87 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  27.87 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  27.87 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  27.87 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  27.87 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  27.87 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  29.18 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.48 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 441 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 464 aa  123  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  29.37 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  28.09 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  28.51 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  28.8 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  29.48 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  28.72 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  27.43 
 
 		 501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  27.29 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  27.09 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  26.85 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  27.07 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.11892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  27.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  27.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  29.05 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  27.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  29.05 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  27.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  29.05 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  27.72 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  27.71 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  29.05 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  27.17 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  27.72 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  26.62 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  26.67 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  26.84 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  29.04 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  33.78 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  30.58 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  27.32 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  26.61 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  28.09 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  28.27 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  29.77 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  32.2 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  28.2 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  30.32 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  28.86 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  26.41 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>