More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6667 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  907    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2179  major facilitator superfamily MFS_1  87.28 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2078  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  86.98 
 
 		 458 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454367  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  69.37 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  57.08 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  32.57 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  29.91 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  30.05 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  30.36 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  29.87 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.6 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.02 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.51 
 
 		 500 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.51 
 
 		 500 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.51 
 
 		 500 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.29 
 
 		 500 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 439 aa  156  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  29.42 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  27.39 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  27.39 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  29.63 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  30.39 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  27.17 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  28.05 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  28.38 
 
 		 501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 439 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.02 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  27.17 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  27.17 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  27.17 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  27.17 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  28.36 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  27.17 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  28.19 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  27.74 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  28.9 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.77 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  27.62 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  30.2 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 426 aa  149  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  30.14 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  30.17 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  29.76 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.49 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  27.01 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.69 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  28.83 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  26.58 
 
 		 500 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  30.41 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  26.58 
 
 		 500 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  26.8 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  29.52 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.35 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.7 
 
 		 435 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  26.58 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.75 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>