More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5238 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  99.07 
 
 		 429 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  850    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  99.3 
 
 		 429 aa  846    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  82.05 
 
 		 445 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  82.75 
 
 		 429 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  96.74 
 
 		 429 aa  829    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  83.56 
 
 		 432 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  80.33 
 
 		 438 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  80.57 
 
 		 438 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  73.67 
 
 		 436 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  72.41 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  70.43 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  69.76 
 
 		 436 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  69.4 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  69.86 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 459 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  68.81 
 
 		 436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  70.27 
 
 		 466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  66.82 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  68.69 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  69.3 
 
 		 436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  68.45 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  69.54 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  69.06 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  69.3 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  69.3 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  68.82 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  69.3 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  68.95 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  68.95 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  68.95 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  68.95 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  68.95 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  68.7 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  68.45 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  62.15 
 
 		 435 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  66.43 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  68.2 
 
 		 445 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  64.25 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  61.14 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  59.11 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  62.05 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  57.94 
 
 		 476 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  57.94 
 
 		 476 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  63.77 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  62.44 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  60.19 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  61.98 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  54.14 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  54.57 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  54.25 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  52.72 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  48.18 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  47.77 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  52.01 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.89 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  45.03 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  42.99 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.22 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  39.22 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  38.08 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  38.08 
 
 		 415 aa  275  9e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  39.27 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.56 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.59 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  34.22 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 485 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  33.58 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.85 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.89 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  33.33 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  35.8 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 485 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  35.17 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.82 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  34.55 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>