More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1306 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  80.85 
 
 		 449 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  868    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  90.62 
 
 		 449 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2078  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.76 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454367  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2179  major facilitator superfamily MFS_1  56.66 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  56.68 
 
 		 376 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  33.1 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.77 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.77 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.77 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  29.84 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  29.35 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  29.12 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  29.12 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.54 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  29.12 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.12 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  29.12 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  29.12 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  29.12 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  28.34 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  28.34 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  28.44 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  31.34 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  29.53 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.42 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  31.1 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.74 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  28.47 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  31.48 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  29.93 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  28.7 
 
 		 500 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  28.22 
 
 		 500 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  30.22 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 688 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  28.57 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  28.57 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  28.57 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  29.53 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  27.32 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  30.92 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  30.77 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  29.48 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  30.98 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  30.82 
 
 		 439 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 441 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  29.57 
 
 		 433 aa  152  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  31.33 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  31.82 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  26.82 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  29.9 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  28.31 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  32.18 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.94 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  31.28 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  31.19 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.68 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>