More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  74.94 
 
 
438 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  100 
 
 
436 aa  852    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  74.94 
 
 
438 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  74.1 
 
 
432 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  73.91 
 
 
429 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  73.67 
 
 
429 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  72.45 
 
 
429 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  73.19 
 
 
429 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  71.9 
 
 
445 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  72.37 
 
 
429 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  68.24 
 
 
435 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  69.67 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  69.14 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  66.43 
 
 
435 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 
433 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  68.29 
 
 
466 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  66.75 
 
 
433 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  63.9 
 
 
462 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  63.9 
 
 
466 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  65.38 
 
 
433 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  63.9 
 
 
459 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  63.02 
 
 
437 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  61.32 
 
 
435 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  67.32 
 
 
430 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  67.32 
 
 
430 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  67.32 
 
 
430 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  67.32 
 
 
430 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  67.32 
 
 
430 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  67.07 
 
 
465 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  63.88 
 
 
436 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  64.59 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  63.88 
 
 
436 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  64.11 
 
 
458 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  64.11 
 
 
458 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  63.88 
 
 
436 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  65.77 
 
 
445 aa  511  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  63.64 
 
 
435 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  64.25 
 
 
445 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  62.59 
 
 
442 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  63.53 
 
 
445 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  61.03 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  60.8 
 
 
442 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  61.48 
 
 
441 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  61.84 
 
 
447 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  56.38 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  56.4 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  57.64 
 
 
487 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  56.4 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  61.78 
 
 
387 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  54.27 
 
 
437 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  55.81 
 
 
438 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  55.86 
 
 
441 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  54.06 
 
 
438 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  55.39 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  54.89 
 
 
441 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  54.39 
 
 
441 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  54.39 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  46.99 
 
 
429 aa  355  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  46.91 
 
 
436 aa  352  8e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  44.76 
 
 
436 aa  349  5e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  45.01 
 
 
436 aa  349  5e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  44.78 
 
 
436 aa  349  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  54.64 
 
 
441 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  44.76 
 
 
431 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  43.09 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  38.12 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  38.12 
 
 
438 aa  273  6e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.2 
 
 
415 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  35.68 
 
 
415 aa  266  7e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.54 
 
 
407 aa  259  8e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  30.99 
 
 
433 aa  255  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  31.48 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.75 
 
 
456 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.29 
 
 
444 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  31.24 
 
 
435 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.05 
 
 
444 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.76 
 
 
444 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
444 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  33.17 
 
 
457 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  34.34 
 
 
444 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 
433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.01 
 
 
443 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  32.41 
 
 
495 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  32.13 
 
 
483 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
485 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  34.85 
 
 
431 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.62 
 
 
485 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
485 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
485 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  40.98 
 
 
434 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  32.75 
 
 
444 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.54 
 
 
485 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  31.71 
 
 
482 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.12 
 
 
433 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>