More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4728 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  80.85 
 
 		 449 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  81.25 
 
 		 449 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2078  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.96 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454367  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2179  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  55.05 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 464 aa  186  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  32.64 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 500 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  31.22 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  30.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  30.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  30.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  30.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  30.68 
 
 		 501 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  31.79 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  31.03 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  31.1 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.72 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  32.79 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  30.22 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  31.41 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  31.09 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  29.06 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  29.61 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  30.43 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  28.33 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  28.83 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  31.55 
 
 		 444 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  29.44 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.68 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  29.89 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  29.2 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  30.67 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  29.21 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.44 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.44 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  25.68 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  29.65 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  29.57 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  32.26 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  29.35 
 
 		 500 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  30.45 
 
 		 456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 445 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 429 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  30.4 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  30.45 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>