More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0234 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  882    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.62 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  33.48 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 465 aa  187  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  29.8 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.8 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  29.8 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  30.27 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  30.27 
 
 		 438 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  30.99 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  31.25 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  28.92 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  29.81 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  28.29 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  29.28 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  29.36 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  28.89 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 628 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  29.84 
 
 		 436 aa  143  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.66 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  31.86 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.11 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.91 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  29.14 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  29.14 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  29.06 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  29.47 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  29.61 
 
 		 435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  28.78 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 445 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  29.37 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  30.46 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  29.37 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  30.46 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  30.46 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  31.8 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  30.69 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  29.19 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  30.77 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  28.57 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  28.82 
 
 		 500 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  31 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  29.33 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  29.33 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  29.47 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  29.68 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.56 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  29.67 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  29.56 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  29.56 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>