More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5798 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  75.23 
 
 		 445 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  893    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  89.53 
 
 		 449 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  71.33 
 
 		 454 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  71.56 
 
 		 454 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  71.56 
 
 		 454 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  73.35 
 
 		 458 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.01 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  30.56 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  29.34 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 628 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  28.76 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  28.76 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  28.76 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  29.78 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  31.75 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  28.04 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  28.54 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  29.8 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  27.95 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  28.27 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  29.23 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.25 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.35 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.02 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  27.23 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  28.01 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.72 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  27.23 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  27.81 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  28.79 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  27.32 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  29.19 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  27 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  27 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  27 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  27 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  27 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  27 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 405 aa  120  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  31.03 
 
 		 437 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  26.91 
 
 		 482 aa  119  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.59 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  28.24 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  28.86 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.14 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  27.84 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  31.25 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  30.35 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  29.27 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  30 
 
 		 503 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  30.89 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  31.03 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.1 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  26.73 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  30.8 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  28.11 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  27.66 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.7 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  26.43 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  26.38 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  28.25 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>