More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1055 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1055  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  838    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.367509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  34.28 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.49 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  31.5 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 493 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  32.21 
 
 		 524 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.05 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  32.67 
 
 		 482 aa  186  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  30.32 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  29.69 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0223  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  31.68 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  33.48 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  30.14 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  31.41 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 454 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  31.61 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.29 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  28.44 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  30.35 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  30.32 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  30.35 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  30.35 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  31.58 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  31.18 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2724  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  31.92 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  31.92 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  31.92 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.57 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  33.33 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 456 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  30.61 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  32.17 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  33.84 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  30.77 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  33.18 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  33.59 
 
 		 483 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  34.18 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  34.4 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  30.89 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  33.59 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  30.71 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  31.22 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  31.71 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  30.19 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>