More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0452 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  916    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  52.5 
 
 
449 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 
451 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
445 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
445 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  50.55 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  51.25 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.47 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
406 aa  197  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
468 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  34.2 
 
 
435 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
474 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.95 
 
 
435 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
427 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.25 
 
 
427 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.17 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  31.43 
 
 
428 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  30.97 
 
 
428 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  30.97 
 
 
428 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
430 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.22 
 
 
432 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.82 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32 
 
 
432 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32 
 
 
432 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  31.14 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  30.72 
 
 
440 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  30.72 
 
 
440 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  30.02 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  31.06 
 
 
440 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  32.95 
 
 
423 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  30.82 
 
 
440 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  31.03 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.89 
 
 
411 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  30.93 
 
 
423 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  31.71 
 
 
423 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  30.8 
 
 
434 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.59 
 
 
442 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  29.86 
 
 
429 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  30.18 
 
 
425 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.18 
 
 
425 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  32.38 
 
 
434 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
439 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
439 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
416 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
433 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.79 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.01 
 
 
433 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
432 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.16 
 
 
425 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
433 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
416 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
433 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
432 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.4 
 
 
432 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.91 
 
 
434 aa  150  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.4 
 
 
432 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.34 
 
 
429 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  30.82 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.13 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  31.54 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.14 
 
 
409 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  28.92 
 
 
418 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  30.49 
 
 
445 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  27.78 
 
 
420 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.14 
 
 
409 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.27 
 
 
445 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  31.63 
 
 
429 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  29.86 
 
 
426 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.4 
 
 
412 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
436 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29 
 
 
409 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
428 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  29.79 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.12 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.17 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.94 
 
 
424 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.8 
 
 
437 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.7 
 
 
424 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  30.36 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  27.91 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  30.36 
 
 
426 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  30.36 
 
 
426 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  31.64 
 
 
429 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  28.7 
 
 
424 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.41 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
419 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.1 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.1 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.44 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.1 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.1 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.1 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>