More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85334 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  100 
 
 		 493 aa  1013    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  49.18 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  42.28 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  37.4 
 
 		 542 aa  336  7e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  38.71 
 
 		 514 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 417 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 417 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  36.87 
 
 		 417 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 420 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  36.14 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  34.9 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  34.9 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  34.9 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  34.9 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  34.9 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  34.9 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  34.65 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  40 
 
 		 547 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  33.77 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 446 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.15 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.15 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.15 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 428 aa  87.4  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 425 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.4 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.4 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  20.75 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  21.1 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  21.1 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  21.1 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  21.1 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  21.1 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  20.51 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  20.51 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  21.74 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  21.55 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  24 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  21.33 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  22.22 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  21.33 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  21.74 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  21.51 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  24 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  21.51 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  21.51 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  21.51 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  21.51 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  24.69 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  22.41 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  21.89 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  21.89 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  21.89 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  22.25 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  21.89 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>