More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3398 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  100 
 
 
411 aa  807    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  59.76 
 
 
409 aa  501  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 
415 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 
410 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  49.27 
 
 
412 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
419 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
419 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
400 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  31.75 
 
 
506 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
400 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
400 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
400 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  31.75 
 
 
506 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  32.41 
 
 
400 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  31.71 
 
 
447 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  31.48 
 
 
505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  31.48 
 
 
399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  31.58 
 
 
381 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  31.3 
 
 
384 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.87 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  31.18 
 
 
381 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  30.47 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  30.25 
 
 
400 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
381 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
381 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
381 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
404 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
399 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  30.47 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.49 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  28.69 
 
 
399 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  28.41 
 
 
399 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  28.41 
 
 
399 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  28.41 
 
 
399 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
419 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
396 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  27.49 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.36 
 
 
392 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 
411 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.25 
 
 
402 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  31.23 
 
 
394 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.27 
 
 
396 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  25.63 
 
 
396 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  25.63 
 
 
405 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  25.63 
 
 
396 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  25.63 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.21 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.56 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  28.73 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  26.63 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  25.91 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  25.91 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
421 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  29.35 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.18 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.87 
 
 
387 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.82 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  24.94 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.32 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.32 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.26 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  26.13 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  27.44 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  26.55 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  26.55 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  25.06 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
408 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  27.47 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.46 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.85 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.83 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.56 
 
 
396 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.42 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.37 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  25.87 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.47 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>