More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2468 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  100 
 
 		 390 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.89 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  30.63 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  30.24 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.12 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.89 
 
 		 506 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  26.89 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.6 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.99 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.19 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2465  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  25.19 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 395 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  26.01 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  26.82 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.85 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  25 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  25 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  25 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  25 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  23.2 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  23.9 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  24.92 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.18 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  28.96 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  26.12 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  26.21 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  25.31 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  26.45 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  24.65 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  26.17 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>