197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2540 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 405 aa  782    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  49.13 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  32.5 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  32.65 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  33.08 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  31.17 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  30.92 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  30.67 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  30.67 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  31.41 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 392 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 400 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  29.6 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  28.3 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  30.02 
 
 		 506 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  29.88 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  29.88 
 
 		 505 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  28.89 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  28.89 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  28.89 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  28.89 
 
 		 396 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  28.79 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  30.36 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  29.72 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.34 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.42 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  29.31 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.09 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.16 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  27.99 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  27.85 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  27.53 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  27.62 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  26.98 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.98 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  26.98 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.64 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.91 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  24.77 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.84 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 521 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>