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for query gene Dfer_1982 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 416 aa  833    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  66.25 
 
 		 411 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  49.75 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  50.62 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.78 
 
 		 409 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.78 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.28 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.1 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.5 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.98 
 
 		 498 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.44 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.15 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.79 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.06 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  39.79 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.95 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  39.53 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  36.63 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.06 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.13 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.74 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  35.68 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.96 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.68 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.52 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.33 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.58 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  37.04 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.04 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.76 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  38.78 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  34.55 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.51 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.88 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.75 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.84 
 
 		 401 aa  212  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  33.85 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.87 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.82 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.59 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.72 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.03 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.58 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.03 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.96 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.2 
 
 		 435 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.99 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.77 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.79 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.67 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.92 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.21 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  34.88 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.14 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.05 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.76 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.65 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.19 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.01 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.81 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.88 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.42 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.76 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.72 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.72 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.72 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.65 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.27 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.4 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.33 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.06 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.76 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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