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for query gene PsycPRwf_0389 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 404 aa  807    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.32 
 
 		 419 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  76.57 
 
 		 419 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.74 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.76 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  41.06 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.28 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  42.86 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.86 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.15 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  38.96 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  38.96 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.47 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.29 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.45 
 
 		 498 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.03 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.1 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.74 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  41.45 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.27 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.07 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.3 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.36 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.77 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.57 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  43.2 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.54 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.52 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.84 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.7 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.16 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.52 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.64 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.11 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.41 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.6 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.84 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  35.76 
 
 		 426 aa  203  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.31 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.57 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.76 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.76 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.57 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.76 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.25 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.81 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.57 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.02 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.29 
 
 		 437 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.03 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.34 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.12 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.95 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.23 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.8 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.79 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.18 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.59 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.89 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.14 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.87 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  36.13 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.73 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.36 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.5 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.88 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.93 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.98 
 
 		 419 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.72 
 
 		 416 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.43 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.38 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.09 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.68 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.09 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.57 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.18 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  34.65 
 
 		 400 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  32.21 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  37.05 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.33 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  33.06 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.58 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.62 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.18 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.57 
 
 		 440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.59 
 
 		 404 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.18 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.28 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.67 
 
 		 401 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.12 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.4 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.58 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.94 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.92 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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