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for query gene Slin_4137 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 409 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  75.06 
 
 		 409 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.84 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.39 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  55.73 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.55 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  50.62 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  42.16 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.76 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.11 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.5 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.92 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  38.24 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.92 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.79 
 
 		 411 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.77 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  39.2 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  35.68 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.15 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  39.79 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  39.53 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.29 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.21 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  39.54 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.54 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.38 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.54 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.57 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.55 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.71 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.22 
 
 		 392 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 419 aa  222  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.56 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  33.51 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.84 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.46 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.01 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.17 
 
 		 412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.17 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.96 
 
 		 396 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.71 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.28 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.4 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  35.14 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  33.42 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.53 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.07 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.59 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.93 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.92 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  33.75 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  36.64 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.76 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.49 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.85 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.91 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.59 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.28 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.65 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.81 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.26 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 434 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.51 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.23 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.61 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.43 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.56 
 
 		 414 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.42 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.38 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.47 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.14 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.14 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.48 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.5 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.18 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  32.32 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.42 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.36 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.36 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.36 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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