More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1841 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 418 aa  823    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  90.41 
 
 		 418 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.17 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.48 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.1 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.47 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.78 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.75 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  38.48 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.48 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.07 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  36.73 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.87 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  38.87 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.5 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  39.11 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  39.11 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.74 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.75 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.91 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.12 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.37 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  37.37 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.23 
 
 		 403 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.67 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.9 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  37.64 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.44 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.82 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.93 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  35.58 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.83 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.15 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.38 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.12 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.53 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.15 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.57 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.55 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.07 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.53 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.12 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.91 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.12 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.06 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.75 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.23 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 399 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.86 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.13 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.6 
 
 		 420 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.5 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.14 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  38.58 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.86 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.59 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  35.96 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.53 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.68 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.66 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.22 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.53 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.08 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.08 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.65 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.08 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.08 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.82 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  34.04 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.92 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.77 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.11 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  34.03 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.25 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.82 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  36.6 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  34.38 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.82 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.1 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.97 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.89 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.85 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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