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for query gene Ksed_20220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
415 aa  784    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  53.65 
 
 
425 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  54.41 
 
 
438 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  49.2 
 
 
424 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  44.42 
 
 
416 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.56 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.2 
 
 
461 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.79 
 
 
417 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.8 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.3 
 
 
416 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.3 
 
 
419 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.3 
 
 
416 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.3 
 
 
416 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  44.42 
 
 
416 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  44.3 
 
 
416 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.05 
 
 
419 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  44.42 
 
 
416 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.43 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.44 
 
 
408 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.01 
 
 
399 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1377  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.3 
 
 
406 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.83 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.13 
 
 
424 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.4 
 
 
414 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3985  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.63 
 
 
439 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675837  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.41 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.6 
 
 
384 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.63 
 
 
439 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4045  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.63 
 
 
439 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.48 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.16 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.03 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.8 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.36 
 
 
425 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.04 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.25 
 
 
403 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.1 
 
 
398 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.41 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.04 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.86 
 
 
419 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.29 
 
 
414 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  38.78 
 
 
398 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  45.5 
 
 
411 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  39.39 
 
 
392 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  39.39 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  40.16 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.16 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.67 
 
 
417 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.16 
 
 
393 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.2 
 
 
394 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 
400 aa  231  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.93 
 
 
394 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.97 
 
 
419 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0234  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.66 
 
 
448 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 
403 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1341  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.41 
 
 
407 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490339  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  38.08 
 
 
407 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.78 
 
 
413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.13 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.31 
 
 
413 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.47 
 
 
410 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.37 
 
 
397 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.78 
 
 
437 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 
400 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  35.31 
 
 
419 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  37.79 
 
 
426 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.27 
 
 
404 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.29 
 
 
409 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  37.66 
 
 
387 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  37.66 
 
 
387 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.57 
 
 
409 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.84 
 
 
396 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.73 
 
 
412 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.1 
 
 
410 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.72 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.68 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  34.7 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.94 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  34.58 
 
 
386 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.88 
 
 
454 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.54 
 
 
406 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 
409 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.09 
 
 
400 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.38 
 
 
401 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  35.84 
 
 
400 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.4 
 
 
411 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.53 
 
 
392 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.07 
 
 
399 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.64 
 
 
405 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.92 
 
 
405 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.8 
 
 
404 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.07 
 
 
401 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.33 
 
 
440 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.2 
 
 
434 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.09 
 
 
414 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.31 
 
 
399 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.07 
 
 
399 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  38.15 
 
 
404 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.2 
 
 
405 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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