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for query gene Slin_3348 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 411 aa  811    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  66.25 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.1 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  53.27 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  54.96 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  50.39 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45 
 
 		 410 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.01 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  41.69 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.3 
 
 		 414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.3 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.46 
 
 		 498 aa  262  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.03 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.48 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.98 
 
 		 412 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  41.22 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  40.85 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.75 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.18 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.69 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  39.28 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.11 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.97 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.88 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.26 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  34.46 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.64 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.26 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  37.88 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.88 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.35 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.86 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.11 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.48 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.75 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.1 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  34.93 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.08 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.08 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.22 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  37.93 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.82 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.72 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.16 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.04 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.68 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.06 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.66 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.57 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.57 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.5 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.77 
 
 		 416 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.01 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.32 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  34.56 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.4 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.91 
 
 		 407 aa  203  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.09 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.86 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.47 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.92 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.47 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.77 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.4 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.4 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.6 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.67 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.42 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.74 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.07 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.44 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.28 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.16 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.32 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.32 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.28 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.26 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.75 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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